Il existe plusieurs plugins permettant de faire cela..

J'ai décidé de prendre celui de Kainomoto, SP UPGRADE (40 $ environ).

Pour info, il existe aussi SP Transfert pour migrer de 1.6 à 3.x vers 3.x 

Au final, cela a plutôt (très) bien marché, malgré la présence de plusieurs plugins (qui existaient heureusement aussi dans une version compatible 3.x).

En résumé, le plugin s'installe sur une version 3.x fraichement installée et récupère directement les infos (fichiers + base de données) de l'ancien site.

voir la documentation:

https://www.kainotomo.com/products/sp-upgrade/documentation

et aussi :

https://www.ostraining.com/blog/joomla/sp-upgrade/